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NCBI数据库的使用和功能介绍NCBI分子生物学数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/NationalCenterofBiotechnologyInformationNCBI首先创建GenBank数据库,在重点开发GenBank的同时,又于1991年开发了Entrez数据库检索系统。该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等数据库的序列信息以及MEDLINE有关序列的文献信息,并通过相关链接,将他们有机地结合在一起。以IL6基因为例:Mapviewer是NCBI网站上提供的一个非常有用的寻找基因的工具,通过Mapviewer你可以了解你感兴趣基因在基因组中所处的位置、基因序列、内含子及外显子的排列、基因的细胞遗传学图、EST、SNP等等许多有用的信息。利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、启动子Promoter如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列蛋白序列:已知一基因序列:CCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCACCCCGGAGCGGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCCACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCTGGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATAGAGGAACATAAAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAAGAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAACAAAATTGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTGAGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATGGATTGAGGCCTCTGGCBLAST可以对核酸和蛋白的多种数据库操作。有几种比较方法可选择:Blastp:一个氨基酸序列与一个蛋白数据库比较Blastn:一个核酸序列与一个核酸数据库比较。Blastx:一个核酸的所有读框与一个蛋白数据库比较,可以用来发现未知核酸可能的蛋白产物。Tblastn:一个蛋白序列与翻译成所有读框的核酸数据库比较。Tblastx:一个核酸的六种读框与一个核酸据库的六种读框比较,但由于计算太复杂在网页中不能应用。Geneinfo:17号染色体功能注释:GeneOntology获取蛋白质的序列信息获取FASTA序列Finddomain填入蛋白质的FASTA序列并提交BIRdomain三级结构显示Thanks