宠物诊疗机构无害化处理制度按照农业部规定处理病死动物和动物病理组织，不得随意抛弃病死动物、动物病理组织和医疗废弃物，不得排放未经无害化处理或者处理不达标的诊疗废水。参照《医疗废弃物管理条例》的有关规定处理医疗废弃物，及时收集本单位产生的医疗弃废物，并按照类别分置于防渗漏、防锐器穿透的专用包装物或者密闭的容器内。暂时贮存设施、设备应当设置安全措施，并及时将医疗废弃物交由医疗废弃物集中处置单位处理。设置专人负责检查、督促、落实本单位医疗弃废物的管理工作。医疗废弃物贮存设施、设备应当定期消毒和清洁。对医疗废弃物进行登记，登记内容应当包括医疗废弃物的来源、种类、重量或者数量、交接时间、处置方法、最终去向以及经办人签名等项目。产生的污水、动物的排泄物，应按照国家有关规定消毒处理后方可排放。