会计学G09的主要(zhǔyào)功能和程序结构光谱计算2.程序结构：a.由主引导模块(mókuài)(g09.exe)和各分模块(mókuài)(l????.exe)组成：b.常用模块的功能：L0—初始化模块；L1—读入输入文件，根据所给关键词确定将要使用的模块；L101,102,…—与构型优化和反应过渡态相关的模块；L202—输出距离(jùlí)矩阵、判断化合物点群及确定新的坐标系；L301,302…309—与基组和赝势有关模块；L310,…319—计算单电子及双电子积分模块；L401,402—SCF初始猜测模块；L502,503,508—SCF模块；L601,608—Mulliken布居以及自然键轨道(NBO)分析模块；L701,702…—计算能量一阶和二阶导数模块；L8??,9??,10??,11??—与Post-SCF方法有关模块；L9999—进程结束模块；c.g09运行过程所使用的文件：在scratch目录/或工作目录下有下列文件：(1)gxx-打头的文件为临时文件，计算(jìsuàn)结束后将自动删除，其中对于结尾为inp的文件，记录了当前g09所执行的输入文件内容，有时可通过该文件确定当前运行作业；(2)chk文件，该文件记录了g09运行的结果，包括分子结构、基组、分子轨道、电荷密度以及偶极矩等，通常该文件在计算(jìsuàn)结束后要保留，便于以后作补充计算(jìsuàn)或计算(jìsuàn)结果处理；(3)rwf文件，该文件记录了计算(jìsuàn)的中间结果，以便在计算(jìsuàn)过程非正常中断后用于续算，该文件通常较大，当作业正常结束后，可删除之。(4)Default.Rou文件，该文件设置一些系统默认参数，例如g09运行时内存和硬盘的大小，其内容如下：-M-256MB(内存大小)-#-MaxDisk=2000MB(硬盘大小)/G09输入(shūrù)文件的编写与使用(1)L0命令部分：该部分内容均以%打头，主要用于指定计算过程所需软硬件的参数，chk以及rwf文件名，其典型内容是：%chk=aa.chk.chk文件包含了所有计算结果,是GaussView分析结果的主要文件%rwf=aa,2000MB,bb,2000MB…….rwf文件是主要读写文件,随体系增大,32位机上单个不能超过2GB,可以分割为2000MB文件,总体不能超过16GB。%mem=600MBPC机上，WinXP系统总内存减去400MB；Linux系统减200MB􀂙%nproc=8指定并行计算使用(shǐyòng)的cpu核的数目%nproclinda=2指定并行计算使用(shǐyòng)的cpu的数目(2)关键词部分：该部分内容由一个或多个关键词组成，用于指定(zhǐdìng)任务类型、理论方法、基组和计算输出的控制等。#[p]method/basis[keyword=(opt1,opt2)][keyword2=(opt1[,opt2])]#hf/6-31g*􀂙#pB3LYP/cc-pvdzopt􀂙#MP2/cc-pvtzmaxdisk=12gb􀂙#HF/6-311g(d,p)freqscf=directnosymmopt􀂙#CCSD=(T,maxcyc=200)/6-31G*opt=tsa.G09任务类型、理论(lǐlùn)方法及基组SP(单点能计算，默认)􀂃Opt(几何构型优化.)􀂃Freq(频率分析，IR.)􀂃IRC(内反应(fǎnyìng)坐标.)􀂃Scan(势能面扫描.)HF(Hartree-Fock方法,默认)􀂃B3LYP(用B3LYP杂化泛函做DFT计算)􀂃MPx(在HF计算结果的基础上做MPx微扰校正，x=2、3、4、5)􀂃CCD(双取代耦合簇方法)􀂃CCSD(单、双取代耦合簇方法)􀂃CID(双取代组态相互作用)􀂃CISD(单、双取代组态相互作用)􀂃AM1(AM1半经验(jīngyàn)算法)􀂃PM3(PM3半经验(jīngyàn)算法，无需设定基组)(3)标题部分：由一行文本组成，该内容(nèiróng)是必需的。(4)电荷及自旋多重度：体系所带电荷以及自旋多重度S=2s+1=成单电子数+1(5)分子构型描述部分：有三种描述分子构型的方法：a.直角坐标系方法：(适用于全自由度构型优化情况)格式为：元素符号xyz例如：O-0.4640.1770.0H-0.4641.1370.0H0.441-0.1430.0说明：1)元素符号大小写均可，也可直接采用原子序数；2)有时为了便于区别，可在元素符号后加一整数，如：O-0.4640.1770.0H1-0.4641.1370.